农村建房拆迁房屋的分配主要需要遵循公平、公正、公开的原则，以确保每个农户都能够公平获得合理的补偿。

首先，农村建房拆迁房屋的分配应当注重保障农民的基本居住权益。政府应根据农户的实际需要和居住状况，进行合理的面积分配。对于居住环境较差的农户，优先提供更好的住房条件，以改善他们的居住条件。

其次，农村建房拆迁房屋的分配应当注重公共利益和社会公平。政府应优先考虑将房屋分配给那些社会公共事务和经济发展中具有重要贡献的农户，如村干部、优秀农民和贫困户等。同时，也应考虑到老人、儿童和残疾人等特殊群体的特殊需求，给予他们更多的关怀和照顾。

此外，农村建房拆迁房屋的分配应进行公正和公开的程序。政府应建立健全的决策机制和分配机构，确保分配的公正性和公平性。在分配房屋时，应当充分听取农户的意见和诉求，保证他们的知情权和参与权。同时，也要及时公布相关政策和规定，向社会公众公开信息，提升分配的透明度和公开度。

最后，农村建房拆迁房屋的分配应当考虑到农户的实际能力和需求。政府应根据农户的经济状况和实际情况，确定合理的补偿方式和金额。对于那些因拆迁丧失经济来源的农户，应给予适当的补偿和帮助，确保他们的基本生活需求得到满足。

综上所述，农村建房拆迁房屋的分配需要综合考虑农户的基本居住权益、社会公共利益、公正公正公开的原则以及个体农户的实际能力和需求等因素，采取合理的分配策略和措施，确保每个农户都能够公平获得合理的补偿。