毛巾消毒方法主要有超温消毒、化学消毒法、紫外线消毒和高压蒸气消毒四种。

超温消毒利用数显微电脑控制器，将控温高温干热作用于微生物，通过过氧化作用破坏细胞原生质，杀死微生物。

化学消毒法采用化学消毒剂，可以选择稀释200倍的清洗消毒剂或0.1％的洗必泰，将毛巾浸泡溶液中15分钟以上，然后清洗干净残留消毒剂，晾干使用。

紫外线消毒方法强效，灯管有15W、20W、30W等，灯管寿命为3000～4000小时。消毒时，灯管距表面不超过1m，灯管周围1.5～2cm为有效范围，消毒时间1～2小时。

高压蒸气消毒是医院常用方法，灭菌快速可靠，无残留毒笥。121℃灭菌时间30分钟，126℃为20分钟，一般压力为1kg/cm2，20～30分钟即可消毒。