地方法规不尽相同，工程报建中提及的建筑工程方案设计是由地方规划主管部门签发的与建设用地规划许可证一起发的规划条件。在满足条件的前提下，在建筑控制线范围内进行的建筑设计方案。

并非整体规划设计方案。城市建筑工程报建流程分为：1、建设用地规划许可证；2、规划条件；3、修建性详细规划；4、建筑设计方案；5、扩初设计、施工图设计。

“ 有关专业主管部门对设计方案的审查意见（复印件1份，核原件）”指的是经主管部门审核的意见书。

由于你的问题都应该通过城市建设申报窗口解释。故在这里只是大概说一下。不能详尽。