高硼硅玻璃杯化学性质不稳定、膨胀系数较大、容易摔碎、含有有毒物质、存在破裂风险。

高硼硅玻璃的化学性质不稳定，耐酸性差，耐碱性也差，不能抵抗水的渗透，长期接触高硼硅玻璃，会造成内部受损，因此要尽量避免盐水、酒精等具有腐蚀性的液体接触高硼硅玻璃。

高硼硅玻璃的膨胀系数较大，容易发生变形，即使是经过加工处理的高硼硅玻璃也不能完全消除玻璃的热胀冷缩，所以不建议使用高硼硅玻璃制作锅具，否则会发生炸裂。

高硼硅玻璃表面光滑度较高，掉到地上很容易摔碎，即使是加工过的高硼硅玻璃也不行。

高硼硅玻璃在温度过高的环境下会析出有毒的铅物质，这种含铅玻璃对人体健康有很大的危害。

由于高硼硅玻璃相对较薄，因此在受到突然的温度变化或机械冲击时会破裂。