建设工程施工许可证由工程所在地县级以上人民政府建设行政主管部门办理。

详细解释如下：

1. 建设工程施工许可证的办理机构：在我国，建设工程施工许可证是建筑施工的法律凭证，其办理机构为工程所在地的县级以上人民政府建设行政主管部门。这些部门负责监督和管理建设工程的安全、质量、进度等方面的管理工作。

2. 部门职责：建设行政主管部门在颁发施工许可证前，会对建设单位提交的申请材料进行审查，确保其符合施工条件，如已取得土地使用权证书、规划许可证等。此外，还要确保项目的建设单位已经确定了施工企业，并已签订施工合同或协议。只有满足这些条件，才能获得施工许可证。

3. 办理流程：办理施工许可证的具体流程包括提交申请材料、部门审查、现场核查等环节。建设单位需按照相关法律法规准备齐全的申报材料，提交至建设行政主管部门。部门审查核实材料真实性、完整性后，会进行现场核查，确保工程具备安全施工的条件。审查通过后，将颁发施工许可证。

4. 重要性：建设工程施工许可证是建筑施工的合法凭证，建设单位在开工前必须取得。没有施工许可证的工程，不得擅自开工。这一规定是为了保障工程项目的合法性和施工过程的规范性，确保工程质量和安全。

总的来说，建设工程施工许可证的办理需遵循相关法律法规，由工程所在地的县级以上人民政府建设行政主管部门负责审查并颁发。这是保障建筑工程合法性和安全性的重要环节。